Ο Ιωάννης Παπαϊωαννίδης γεννήθηκε και μεγάλωσε στην Ναύπακτο με καταγωγή από την Αμπελακιώτισσα Ορεινής Ναυπακτίας.
Με σπουδές στον Επιχειρηματικό Σχεδιασμό και τα Πληροφοριακά Συστήματα, επαγγελματικά δραστηριοποιείται στον κλάδο των ξενοδοχειακών επιχειρήσεων συνεχίζοντας την οικογενειακή παράδοση. Διαθέτει ξενοδοχειακή μονάδα στην Άνω Χώρα Ναυπακτίας, ενώ στο παρελθόν εργαζόταν στο τουριστικό κατάλυμα που διατηρεί η οικογένειά του στην Ελατού Ναυπακτίας, καθώς και σε άλλα καταλύματα ως υπεύθυνος.
Συμμετείχε για πρώτη φορά στις αυτοδιοικητικές εκλογές του 2019, οπότε και εξελέγη Δημοτικός Σύμβουλος Δημοτικής Ενότητας Αποδοτίας. Επανεξελέγη στις αυτοδιοικητικές εκλογές του 2023.
Από την 1.1.2024 έχει αναλάβει καθήκοντα Αντιδημάρχου Διεύθυνσης Τεχνικών Υπηρεσιών (Τμημάτων Μελετών, Τεχνικών Έργων, Μεταφορών και Συγκοινωνιών) και Δημοτικής Ενότητας Αποδοτίας. Είναι επίσης μέλος της Δημοτικής Επιτροπής.
Τη δημοτική περίοδο 2019-2023 διετέλεσε αρχικά Αντιδήμαρχος Διεύθυνσης Διοικητικών Υπηρεσιών, Αντιδήμαρχος Δημοτικής Ενότητας Αποδοτίας, ήταν υπεύθυνος του Τμήματος Αδειοδοτήσεων, Ρύθμισης Εμπορικών Δραστηριοτήτων και Απασχόλησης και Πρόεδρος της Επιτροπής Ποιότητας Ζωής (2019-2021). Στη συνέχεια ανέλαβε καθήκοντα Αντιδημάρχου Διεύθυνσης Τεχνικών Υπηρεσιών (2021-2023). Καθ’ όλη τη διάρκεια της δημοτικής περιόδου ήταν και Αντιδήμαρχος του Αυτοτελούς Τμήματος Προγραμματισμού, Οργάνωσης, Πληροφορικής και Διαφάνειας, καθώς και μέλος της Οικονομικής Επιτροπής Δήμου Ναυπακτίας.
Γνωρίζει αγγλικά και γαλλικά.
